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2、主體語言問題。

《中外合作辦學條例》第31條規定：“中外合作辦學機構根據需要，可以使用外國語言文字教學，但應當以普通話和規范漢字為基本教學語言文字。”這個條例的規定也是有些不合時宜的。在目前經濟全球化的形勢下，世界各國都以全球化為特色，而目前來說，全球商務活動的通用語言主要是英語，要造就全球性的人才，培養適應全球發展的成功商界領袖和講求實效的創業者，這一切無疑都需要有良好的溝通基礎;且現在許多先進的技術、管理經驗、最新的資料等大都是用英語表述的，在這種情況下還苛求使用中文教學無疑是行不通的，也是不合時宜的。

3、對中外合作辦學的定性難以確定。

目前在《中華人民共和國中外合作辦學條例》中僅僅以學歷教育和非學歷教育分類，這樣的分類是很不明確的。而中外合作辦學性質的劃分究竟是應該按照所有制分，還是按照合作性質分，或是按照學科分類等，這些都沒有明確的定義。也正是因為這些含糊不清的概念使得民眾趨向把中外合作辦學項目視做民辦教育，而這種提法顯然是不合適的。