科研合作，2017年10月超強激光光源聯合實驗室實現10拍瓦(1拍瓦=1千萬億瓦)激光脈沖輸出，達到國際領先水平。學校積極推動科教與產業的融合，與多家國內外高科技企業開展產學研合作，技術成果轉移轉化取得一系列進展。

2016年4月15日，國務院發布《上海系統推進全面創新改革試驗加快建設具有全球影響力的科技創新中心方案》，明確指出上科大在上海張江綜合性國家科學中心建設中承擔重要任務。目前，學校正與中科院上海分院科研院所等單位合作，負責或參與建設軟X射線自由電子激光用戶裝置、活細胞結構和功能成像等線站工程、超強超短激光實驗裝置、上海光源二期線站工程(納米自旋與磁學線站、高性能膜蛋白晶體學線站)，牽頭硬X射線自由電子激光裝置的規劃和建設，承擔“多空間多時間尺度生物成像平臺”、“機器學習與虛擬現實平臺”等科創中心建設重點建設工作，力爭為上海科創中心建設做出重要貢獻。